家系性男性Y-AmelogeninDYS458基因同时缺失1

陶晓岚,聂笑联  

(甘肃省公安厅DNA室,   甘肃 兰州  730030  

 

摘要 目的  通过一例家族性男性Y染色体Amelogenin基因和DYS458基因座的缺失的检验和群体调查,初步分析Y染色体缺失的原因,通过检验过程总结在强奸案件DNA检验中应注意的问题。方法 一东乡周姓家族三代男性常染色体STRYSTR的荧光检测分型,一般群体遗传数据的调查,所得数据进行统计学和遗传学分析。结果 先证者、其父和侄子三代均为Amelogenin Y基因和DYS458基因座的缺失。

关建词  Y染色体;东乡族  Amelogenin  Y染色体缺失 

   位于XY染色体上的Amelogenin gene(牙釉质蛋白基因),编码原牙釉质蛋白。X染色体的Amelogenin gene位于Xp22,Y染色体上位于Y11p22.2,由于Amelogenin XAmelogenin Y上碱基缺失片段长度不同,根据碱基部位两侧的同源序列的碱基排列顺序设计出引物以同步扩增XY特异性片段进行性鉴定。该法广泛用于法医DNASTR多态性检测试剂系统中,如ABidentifiler 等。在实验中Amelogenin基因座上,男性样本扩增出二条带,一条为X染色体上的106bp的产物带,另一带为Y染色体上的112bp的产物带。我们在检案中遇到一例家族性男性Amelogenin-Y扩增缺失,并对其进行了初步探讨,现报告如下。

1一般情况

1.1 案例

2005518在东乡县河滩镇粮站某宿舍内发生一起轮奸案,受害人为陈家燕(女,15岁)。东乡县公安局在该案侦查中提取了陈家燕内裤、红色外裤和嫌疑人周文某、马某、周胡某、周木某和周二某的血样,送检做DNA同一认定。

1.2实验材料与方法

按行标GA/T383-2002中标准方法,上述12号检材陈家燕内裤、红色外裤抗人精P30试验呈阳性,用二步分离法从受害人内裤和外裤上斑迹中提取精子DNA;用chelex法从周文某等嫌疑人血样中提取DNA,使用Identifiler试剂盒进行PCR复合扩增,扩增产物应用ABI-3100AvantDNA序列分析仪电泳分离和激光扫描分析,得到上述检材的常染色体DNA-STR基因分型。

1.3结果

从上述物证及有关嫌疑人血样标本的常染色体DNA分型相同结果如下表。

1  相关检材的常染色体DNA-STR多态性检验结果:

 

D8S1179

D21S11

D7S820

CSF1PO

D3S1358

TH01

D13S317

D16S539

内裤

14/16

28/29

9/11

12

15/19

7/9

11

12

外裤

10/15

29

11/13

10/11

15/17

8/9

12/13

11/13

周木某

14/16

28/29

9/11

12

15/19

7/9

11

12

周文某

10/15

29

11/13

10/11

15/17

8/9

12/13

11/13

 

 

D2S1338

D19S433

VWA

TPOX

D18S51

D5S818

FGA

Amelogenin

内裤

23/25

13

14/17

10/11

14/20

12/13

21/25

X/Y

外裤

17/23

13/15.2

14/18

8

16/21

11/12

24

X

周木某

23/25

13

14/17

10/11

14/20

12/13

21/25

X/Y

周文某

17/23

13/15.2

14/18

8

16/21

11/12

24

X

 

内裤上可疑斑迹是精斑,检出的精子常染色体DNASTR基因型与嫌疑人之一周木某血样DNA分型的似然比大于7.39×1016。外裤上可疑斑迹是精斑,检出的精子常染色体DNASTR基因型与嫌疑人之一周文某血样染色体DNA-STR分型结果一致,似然比大于5.58×1016 ,然而结果显示,其Amelogenin 基因座只检测到一条X带,106bp峰。附图谱。

2 复核及调查

2.1 要求送检受害人陈某的血样,结果常染色体STR分型结果与上述外裤斑迹中检出的STR分型不同。

2.2周文某一般情况   周文某现年20岁,系甘肃省东乡县人,初中文化。法医体检示:一般发育正常,典型男性外貌,身高168cm,体重61kg, 胡须和男性外生殖器等男性性征发育良好,附照片。

2.3 家族调查  周文某,未婚,父母健在,父亲周某某,现年52岁,东乡族,无遗传病及传染病史;母亲马氏,现年51岁,东乡族,无遗传病及传染病史;有一亲哥及亲侄。其侄周某,男,6岁,东乡族。法医体检,男性体征正常,发育良好。

2.3 血样DNA分析结果。提取了周某某、周某静脉血样及口腔拭子并重新提取了周文某的血样及口腔拭子,经IdentifilerYfiler复合扩增得常染色体STRY染色体STR分型结果。见表2及表3

2 常染色体DNA-STR分型结果

 

D8S1179

D21S11

D7S820

CSF1PO

D3S1358

TH01

D13S317

D16S539

周文某之父

13/15

29/31

11

11

15/17

7/8

8/13

9/11

周文某之侄

14/15

29/31

10/13

7/10

16/17

8/9

8/9

11/12

 

检材

D2S1338

D19S433

VWA

TPOX

D18S51

D5S818

FGA

Amelogenin

周文某之父

20/23

13

16/18

8

13/16

11/12

23/24

X

周文某之侄

17/18

13/15.2

16/17

8

13/15

11/12

22/23

X

 

3 Y染色体STR分型结果

 

DYS456

DYS389I

DYS390

DYS389II

DYS458

DYS19

DYS385

DYS393

周文某之父

16

13

25

31

-

16

11

13

周文某之侄

16

13

25

31

-

16

11

13

周文某

16

13

25

31

-

16

11

13

 

检材

DYS391

DYS439

DYS635

DYS392

Y-GATA

DYS437

DYS438

DYS448

周文某之父

12

11

23

11

13

14

10

20

周文某之侄

12

11

23

11

13

14

10

20

周文某

12

11

23

11

13

14

10

20

 

3讨论

Y染色体属中着丝粒染色体,除拟染色区外,大部分区域在减数分裂时不发生重组,呈单倍型遗传。ABYfiler检测的上述STR基因座,均位于拟常染色区之外,不发生重组,基因型呈父系遗传特征,所以检测YSTR基因可以确定同一父系的群体。   本例报道的一家三代先证者周文某、其父和其侄三人在AmelogeninY Y-STR DYS458均未检出扩增产物,证实属于Y染色体部分基因的缺失。Y染色体基因的缺失国外有报道,国内少见报道,本例调查属于一家族性Amelogenin Y的扩增缺失,并伴有YSTR基因座DYS458的扩增缺失,属罕见的家族性Y染色体基因缺失,并有稳定的遗传性。

本例Y染色体基因缺失家族,系甘肃特有的少数民族东乡族。东乡族群集居住在甘肃的西南部东乡县,全县约有东乡族居民  人,约在200多年前游牧到此定居,通过Y染色体多态性的检测可以追溯该家族的群体迁移史,进一步研究该民族的迁移过程。

引起Y染色体基因缺失的原因有多种,根据本例结果, Amelogenin Y基因座位于中心粒附近,定位于Y11P22.2DYS458基因座也位于Yq靠近中心粒的位置,综合分析初步认定应为Y染色体的中心粒附近片段的缺失。深入的研究,有待从染色体形态、Y染色体全基因序列分析及更广泛的群体调查得出。

根据图谱分析,本例不属于纯合子XX男性,因为X106bp峰值比邻近的D5S818低,若是XX通常会明显高于D5S818;且Y-STR检出分型说明该家族男性个体有Y染色体。

应充分认识Y染色体在个体认定中的有限作用,因父系的所有男性YSTR分型相同,在确定嫌疑时不能单凭YSTR的检验,只有在常染色体STR结果不理想或不足以认定时,才用YSTR作为辅助鉴定,当二者都达到一定似然比率时,才可确定嫌疑人。

强奸案件的检验应同时送检受害人的血样作比对。本案属于一起轮奸案,首次送检仅送了现场物证和嫌疑人的样品,未送检受害人的血样。因检出的精子DNAX型,曾怀疑办案单位是否将样本送错,二次要求送检了受害人的血样及嫌疑人周文某的血样进行二次检验和比对。

在案件的检验中,遇到男性的Amelogenin gene基因座上只检出一条X带的情况,若不做受害人的血样比对,有可能作出未检出精子DNA的结论,会造成漏检的后果。因此在强奸案DNA分析中送检受害人的血样做比对是十分必要的。

 

参考文献

[1] 刘文,郭景元,李伯龄,等,中国刑事科学技术大全,法医物证学2001418-439619-624.

[2] 郑秀芬,法医DNA分析,2002371-373.

 

 

[作者介绍]  陶晓岚(1964-),女,甘肃兰州人,副主任法医师,医学学士,主要从事法医物证DNA鉴定及研究工作。电话13919275696/09318536720